恒溫熒光擴增儀主要是用來定量分析和確定基因轉錄水平的，而普通基因擴增儀是做定性分析和擴增基因片段，熒光定量基因擴增儀可以做普通基因擴增儀的工作，而反之就不行了，況且這樣代價太大了，一般的實驗室都不允許這樣做的?？傊畠烧叩墓δ懿荒芑ハ嗳〈?div>　　普通基因擴增儀只能夠定性地分析是否存在目標片段。但是價格要低很多，而且運行成本也要低很多。不過不能直接得到擴增結果，還需要做電泳檢測。實際中檢測遺傳疾病，品種分子標記篩選，甚至親自鑒定等都可以由普通基因擴增儀完成。